En el marco del Estado de Emergencia que rige en Panamá, el gobierno de ese país modificó las medidas sanitarias para los pasajeros panameños y residentes extranjeros que ingresen al país.
El Ministerio de Salud de ese país emitió una resolución en donde establece que todo pasajero que ingrese al territorio panameño deberá presentar certificado de prueba hisopado/PCR negativa un máximo de 96 horas previo al abordaje. La resolución anterior establecía un tiempo máximo de 48 horas previo al ingreso al país. Estas medidas aplican para vuelos previamente autorizados por el Ministeiro de Salud.
Se pide firmar una aceptación en la declaración jurada, proporcionada por la aerolínea, mediante la cual el pasajero se compromete a cumplir con las medidas de control sanitario y protocolos de salud que disponga el Gobierno Nacional a través del Ministerio de Salud. Se exige la utilización de la aplicación para el monitoreo de aparición de síntomas y confirmación de cuarentena u otras medidas que disponga el Ministerio para la debida trazabilidad del pasajero; y facilitar el teléfono fijo de la residencia donde realizará la cuarentena.
Actualmente Copa opera vuelos desde agosto y hasta septiembre bajo condiciones del Centro de Operaciones Controladas. A partir del 12 de octubre Panamá procederá a reactivar la aviación internacional, según lo establece el Plan Actualizado de Reapertura Nacional-Provincial aprobado por el Consejo de Gabinete. Los vuelos internacionales de aviación comercial y de transporte de pasajeros, se han mantenido suspendidos desde el 22 de marzo, por orden del Gobierno Nacional, tras el inicio de la pandemia de COVID-19 en Panamá.
